揭秘:Omicron如何被發(fā)現(xiàn)的?一封重要的電郵
當(dāng)?shù)貢r(shí)間 11 月 25 日摇天,南非國(guó)家傳染病研究所 ( NICD ) 發(fā)表聲明表示粹湃,已在南非檢測(cè)到一種新型新冠病毒變種 B.1.1.529。一天后泉坐,世界衛(wèi)生組織將其命名為 " 奧密克戎 ( Omicron ) "为鳄。
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Omicron如何被發(fā)現(xiàn)的
2021-12-2 09:23 上傳
▲ 11 月 4 日,南非首都比勒陀利亞的一家柳葉刀實(shí)驗(yàn)室首次發(fā)現(xiàn)了新冠病毒常規(guī)檢測(cè)數(shù)據(jù)中的異常情況
世衛(wèi)組織在聲明稱腕让,首例已知的奧密克戎感染是來自 11 月 9 日在南非收集的一個(gè)標(biāo)本孤钦。不過,據(jù)南非媒體 29 日?qǐng)?bào)道纯丸,早在 11 月 4 日偏形,南非首都比勒陀利亞的一家實(shí)驗(yàn)室便首次發(fā)現(xiàn)了新冠病毒常規(guī)檢測(cè)數(shù)據(jù)中的異常情況。(此前報(bào)道:新冠最新變種 11 月初已出現(xiàn),專家:各國(guó)旅行禁令恐 " 為時(shí)已晚 ")
11 月初報(bào)告:
S 基因缺失壳猜,意味著 " 可能發(fā)生突變 "
當(dāng)?shù)貢r(shí)間 11 月 4 日下午勾徽,初級(jí)科學(xué)家艾麗西亞 · 維穆倫 ( Alicia Vermeulen ) 在實(shí)驗(yàn)室當(dāng)天處理的大約 300 個(gè)測(cè)試結(jié)果中發(fā)現(xiàn)了一個(gè)異常的陽性結(jié)果,而她當(dāng)時(shí)并沒有意識(shí)到此次觀察將引發(fā)一系列關(guān)系到全球的事件忿震。
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2021-12-2 09:23 上傳
▲ B.1.1.529 毒株共有 32 處刺突蛋白突變
這項(xiàng) " 異常 " 的測(cè)試沒有檢測(cè)到一種特定的基因斗黍,即制造尖峰蛋白的 S 基因,雖然在樣本中發(fā)現(xiàn)了可以將其判定為陽性的另外兩個(gè)基因肚浴。但是掷佑,S 基因的缺失標(biāo)志著有些東西可能已經(jīng)發(fā)生了變化,這用專業(yè)術(shù)語來說是 "S 基因靶標(biāo)失效 ( S-Gene Target Failure , SGTF ) "淡碟。實(shí)際上霹壁,S 基因 " 消失 " 表明它可能發(fā)生了突變,只有在這種情況下一步,它才無法被檢測(cè)到剿稼。
" 這激起了我的好奇心。我們想知道是什么導(dǎo)致了 S 基因靶標(biāo)失效率满,因?yàn)樵缙谖覀冊(cè)诎柗ㄗ兎N上看到了類似的情況茂禁。" 擁有醫(yī)學(xué)病毒學(xué)碩士學(xué)位的維穆倫后來在接受媒體采訪時(shí)說。
在注意到這個(gè)異常之后夷呐,維穆倫便通知了該實(shí)驗(yàn)室的負(fù)責(zé)人和經(jīng)理瞻窗。第二天,她發(fā)現(xiàn)了一個(gè)類似的異常結(jié)果悼做。在接下來的一周里疯特,又發(fā)現(xiàn)了更多……維穆倫表示,這種帶有 S 基因靶標(biāo)失效的陽性結(jié)果數(shù)量出現(xiàn)迅速增加肛走。
維穆倫回憶道漓雅,在新冠疫情的高峰期,實(shí)驗(yàn)室處理的樣本一天最多可達(dá) 3000 份羹与。在過去一個(gè)多月的疫情平穩(wěn)期故硅,她負(fù)責(zé)分析檢測(cè)結(jié)果," 起初我們認(rèn)為這可能又是阿爾法變種纵搁,但我們還是決定密切關(guān)注它吃衅,因?yàn)槿绻瞧渌淖兎N,我們就可以立即發(fā)出警報(bào)腾誉。" 維穆倫說徘层。作為同樣被列為 " 需要關(guān)注的變異株 ",阿爾法變種于 2020 年 11 月首次在英國(guó)被發(fā)現(xiàn)利职。當(dāng)時(shí)趣效,阿爾法發(fā)生了類似的 S 基因靶標(biāo)失效瘦癌。
【一封電郵】
引起專家關(guān)注,確認(rèn)新變種
" 在接下來的一周里绊叙,我們發(fā)現(xiàn)了更多類似的陽性結(jié)果填丢,存在同樣的 S 基因缺失。到了星期四(11 月 11 日)夸营,我們決定給格拉斯博士發(fā)電子郵件敞灸,詢問她是否在其他地方看到同樣的情況。" 維穆倫提到的格拉斯博士是南非新冠病毒部長(zhǎng)級(jí)咨詢委員會(huì)的成員贫介,同時(shí)也是這家實(shí)驗(yàn)室的臨床病毒學(xué)家和分子病理學(xué)負(fù)責(zé)人区酷。
報(bào)道稱,格拉斯博士每天會(huì)收到幾百封電子郵件翠蓄,但她立即注意到維穆倫和她的團(tuán)隊(duì)發(fā)來的電郵丛幌,并立即采取了行動(dòng)。
不過抢纹,在 11 月 11 日至 18 日期間懒碍,南非全國(guó)范圍內(nèi)每日?qǐng)?bào)告的新冠病毒感染病例不到 500 例,因此可用于研究的陽性樣本非常少谚剿。格拉斯博士審查了約翰內(nèi)斯堡實(shí)驗(yàn)室提供的結(jié)果杯道,并安排從維穆倫所在的比勒陀利亞實(shí)驗(yàn)室運(yùn)送陽性樣本過來研究。同時(shí)责蝠,她提醒了 NICD 的首席病理學(xué)家安妮 · 馮 · 戈特伯格教授。隨后萎庭,NICD 也開始查看該國(guó)國(guó)家衛(wèi)生實(shí)驗(yàn)室服務(wù)檢測(cè)的數(shù)據(jù)霜医,其中一些檢測(cè)使用了與首次發(fā)現(xiàn) S 基因缺失同一類型的 PCR 測(cè)試。
" 我們?cè)诎柗ㄗ兎N中看到了 S 基因靶標(biāo)失效驳规,但隨著德爾塔變種占主導(dǎo)以后肴敛,我們已經(jīng)有好幾個(gè)月沒有看到類似的情況了。因此吗购,當(dāng)維穆倫說他們發(fā)現(xiàn)了許多類似結(jié)果時(shí)医男,我的第一反應(yīng)是‘一個(gè)批次中只有一兩個(gè)陽性算是很多嗎’。" 格拉斯博士表示捻勉,他們最開始沒有重視這一情況镀梭。隨后,在審查了維穆倫所在的比勒陀利亞實(shí)驗(yàn)室的數(shù)據(jù)后踱启,她才意識(shí)到這一趨勢(shì)呈現(xiàn)的是檢測(cè)結(jié)果的陽性率正在上升报账。
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Omicron如何被發(fā)現(xiàn)的
2021-12-2 09:23 上傳
德奧利維拉表示,截至 11 月 21 日庵恨,在陽性樣本中檢測(cè)到 S 基因靶標(biāo)失效的數(shù)量大幅上升
格拉斯博士及其團(tuán)隊(duì)花了幾天的時(shí)間來收集足夠的樣本迄帘,并將 " 相當(dāng)大規(guī)模 " 的一批樣本送到 NICD。11 月 19 日晚間,拉奎爾 · 維亞納博士受格拉斯邀請(qǐng)對(duì)樣本進(jìn)行測(cè)序榔况,并在接下來的幾天內(nèi)攜手來自 NICD 的科學(xué)家們進(jìn)行了更廣泛的分析和測(cè)序工作峡逆。11 月 25 日,南非科學(xué)家德奧里維拉首次正式確認(rèn)了 B1.1.529 變體(后被命名為奧密克戎)的存在钩榄。
【政客抨擊】
過早發(fā)布導(dǎo)致南非被孤立 專家:這一宣布及時(shí)且重要
據(jù)南非媒體報(bào)道念弧,關(guān)于新變種存在的聲明受到了該國(guó)某些政客的強(qiáng)烈反對(duì)。在全球?qū)δ戏羌捌渌喜糠侵迖?guó)家實(shí)施旅行禁令之后氮妆,這些政客對(duì)德奧里維拉在對(duì)該變體有更多了解之前就宣布這些發(fā)現(xiàn)提出了批評(píng)偶村。但格拉斯博士強(qiáng)調(diào),這種批評(píng)是錯(cuò)誤的匹溪。尤其對(duì)醫(yī)院來說娶架,這一宣布及時(shí)且特別重要,因?yàn)檫@樣可以讓一線的醫(yī)護(hù)人員保持對(duì)病毒的了解并做好準(zhǔn)備玩冷。她說窿侈," 讓全國(guó)人民知道有新的東西出現(xiàn),這是我們將其影響降到最低并讓每個(gè)人都做好準(zhǔn)備的唯一途徑秋茫。對(duì)這些信息坐視不理是不行的史简。"
對(duì)于奧密克戎變異株攜帶的大量突變,尤其是關(guān)鍵的刺突蛋白突變引起了人們對(duì)其可能逃避疫苗免疫的擔(dān)憂肛著,這些研究人員相信圆兵,現(xiàn)有的疫苗仍將很好地保護(hù)人們免受重癥和死亡的影響,不過枢贿,圍繞奧密克戎的關(guān)鍵問題可能還需等上 " 幾周 " 才能知曉答案殉农。
紅星新聞
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